El H. Consejo Universitario como máximo órgano de gobierno es la instancia en la que se analizan, discuten y acuerdan los asuntos institucionales fundamentales de nuestra institución, en los distintos ámbitos de la vida universitaria. Uno de los grandes logros de la reforma universitaria en su aspecto legal y normativo ha sido la reestructuración de este órgano colegiado, lo que ha permitido sesionar en forma regular, periódica y relevante siempre con quórum especial. En todas las sesiones se ha tenido una asistencia superior al 90% de sus integrantes, lo que da legalidad y legitimidad a sus acuerdos.

Asimismo, se ha logrado el funcionamiento permanente de sus comisiones, emitiendo dictámenes para ser sometidos al pleno del H. Consejo Universitario, siendo una importante aportación a la práctica legislativa de la universidad pública mexicana. Todos los acuerdos sin excepción son publicados puntualmente en la Gaceta Universitaria para su cumplimiento y observancia.